Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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HIF3AQ9Y2N7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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HIF3AQ9Y2N7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIF3AQ9Y2N7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIF3AQ9Y2N7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIF3AQ9Y2N7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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HIF3AQ9Y2N7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIF3AQ9Y2N7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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