Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFR3BQ9Y2G0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFR3BQ9Y2G0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms