Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HPS5Q9UPZ3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms