Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms