Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH22Q9UJ99 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms