Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDAC6Q9UBN7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HDAC6Q9UBN7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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