Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TBCCD1Q9NVR7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms