Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FANCFQ9NPI8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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