Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCD2Q9BXW9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCD2Q9BXW9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms