Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRRTQ9BXP5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms