Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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CHCHD7Q9BUK0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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CHCHD7Q9BUK0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CHCHD7Q9BUK0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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