Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2AFJQ9BTM1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2AFJQ9BTM1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms