Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms