Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3CQ99985 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms