Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SGCZQ96LD1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SGCZQ96LD1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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