Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms