Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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