Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUB2Q96DC9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms