Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF34Q969K3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms