Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASKIN1Q8WXD9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms