Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms