Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms