Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APTXQ7Z2E3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms