Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTF1AQ7RTS3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms