Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms