Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3CQ6NXT2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3CQ6NXT2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3CQ6NXT2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3CQ6NXT2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3CQ6NXT2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3CQ6NXT2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3CQ6NXT2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H3F3CQ6NXT2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H3F3CQ6NXT2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3CQ6NXT2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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