Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GDF6Q6KF10 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms