Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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