Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms