Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms