Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NRF1Q16656 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms