Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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