Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms