Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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PSMD5Q16401 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PSMD5Q16401 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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PSMD5Q16401 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD5Q16401 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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