Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CNGA3Q16281 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CNGA3Q16281 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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