Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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