Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TRIP10Q15642 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms