Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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IRF4Q15306 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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IRF4Q15306 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IRF4Q15306 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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IRF4Q15306 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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