Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK2Q15119 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK2Q15119 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK2Q15119 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK2Q15119 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDK2Q15119 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDK2Q15119 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms