Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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