Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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COL19A1Q14993 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL19A1Q14993 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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