Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms