Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RASGRF1Q13972 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms