Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NCOA4Q13772 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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