Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX3Q13761 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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