Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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