Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SCGB2A2Q13296 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms