Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms