Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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