Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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